烟叶贮藏期害虫的主要来源是：农户及收购的房舍中或包装物料上或仓库的墙壁、垫板及器材的缝隙中附有害虫，或因仓库密封不严，烟叶贮藏时害虫进入仓内危害等。根据贮藏期害虫的发生特点及传播途径，可采取如下方法进行防治：
1.使用熏蒸剂。
毒气作用于害虫的呼吸系统，中止其呼吸化学过程，导致害虫死亡。熏蒸剂具有渗透性强、杀虫效率高、易于散失等特点。熏蒸剂的种类有磷化铝片、溴甲烷、硫酰氟、环氧乙烷与CO2混合物(1∶9)等。国外也采用磷化镁熏蒸。磷化铝可穿透到烟堆内部杀虫，是目前生产上最常用的药剂。磷化铝在空气中遇水气后分解产生磷化氢毒气，二氧化碳和氨气，故可用于熏蒸杀虫。每片磷化铝重约3g，产生磷化氰1g左右。熏蒸时磷化铝的一般用量为5～7g/m3。熏蒸的效果与仓库密封性能有很大的关系。密封良好的仓库每t烟用药3～5片，空仓012～014片/m3，而密封较差仓库：每t烟用药15片，且由于毒气浓度太低，不能杀死害虫。国内仓库密封性能不高，密封熏蒸时不能达到杀死各个虫态害虫的目的，可采用塑料薄膜密封熏蒸。也可用溴甲烷，适于在低温条件下(6℃以上)使用。溴甲烷多被压缩成液体并装在钢瓶内，国产钢瓶装的溴甲烷有I型和II型。仓库熏蒸多用II型装的，既可在仓内施药，也可在仓外施药。溴甲烷的主要优点是对熏蒸人员危险性较小，使用简便安全，易储藏，渗透力强，杀虫效力高，并可杀菌灭鼠，熏蒸后散气快。缺点是对人无警示性，中毒后不易恢复，有积累性中毒，且会使含氮量较高的雪茄烟叶变味。同时溴甲烷为一种破坏大气臭氧层的物质，蒙特利尔协议规定，2015年停止使用溴甲烷。
禁止在烟叶中使用的熏蒸剂有：氢氰酸、氯化苦。氢氰酸有损于烟叶品质，氯化苦用后有严重残留，且不易挥发。
2.性信息素
性信息素一般用于虫情检测，以确定防治适期及防治措施。它灵敏度高、选择性强、对人畜无害、不污染环境。
诱捕器应在仓库的环境温度超过15℃时使用，诱捕器的设置位点、数量应固定。若每个诱捕器每周诱捕到10个以内烟草甲虫为正常，超过30头需要进行防治。